Peraí, eu gostaria de entender melhor o que você disse (o hardware a esquerda do leitor com ele deitado?).
Quanto ao leitor eu não vou discutir, preciso ver um teste e uma análise clara que ele na vertical teria uma vida útil menor. Quando ao arrefecimento geral vou falar do X360 que é o console que tenho, pelas fotos que já vi de um PS3 Slim desmontado, a abordagem dele é um pouco diferente (mas continua valendo).
No X360 (antigo modelo) a GPU fica abaixo do leitor, com um minuscúlo dissipador de perfil baixo. Ele dissipa um bocado de calor, mal consigo deixar meu dedo por 2 segundos e quando fiz este teste evidente que tive que tirar o leitor de cima, no que imagino que seja muito pior com ele montado. Pois bem, dito isso, o X360 deitado (na posição horizontal) o leitor recebe todo o calor do dissipador da GPU, além de atrapalha a dissipação do mesmo, apesar de existir um tunel de vento traseiro com duas ventoinhas de 60 mm exaurindo o calor da dupla GPU e CPU (este a direita do leitor, sem obstáculos).
O X360 possui abertura por todos os lados, seja na traseira, quanto nas laterais (abordando o console tanto na vertical quando na horizontal). Notei que se usá-lo na horizontal como fazia, ele em baixo esquenta bastante, como seria óbvio já que naquela região encontra-se a placa-mãe, mesmo que existam aberturas, mas além do pouco espaço para fluir (com os calços originais), o ar quente sobe e não desce.
Ao usar o console na vertical nota-se que como o ar agora pode fluir pelas laterais, superior e traseiro, a região da placa-mãe (agora a esquerda) esquenta muito pouco. O único entrave aqui mesmo acaba sendo o calor da CPU não podendo fluir para cima por causa do leitor, mas isso não é um problema quando se tem aberturas pelas laterais e traseira (com o tunel de vento ativo), portanto para a forma que o X360 foi consebido (repito, no antigo modelo), esta posição é a melhor no que tange a dissipação térmica.
A única dúvida mesmo de minha parte fica em relação a vida útil do leitor, mas como no X360 a instalação completa de jogos é permitida, o leitor praticamente não é usado já que a leitura é totalmente do HDD.