Acho que qualquer gerenciador faz isso... é só adicionar prioridade aos arquivos.
Tipo no bittorent, você bota 1 pra baixar e deixa o outro em pausa. Nas configurações você muda uma opção que faz com que, logo após acabar o download corrente, comece o download que estava pausado.
Procure uma opção assim.
Falow \,,/