Cara, eu tive uma placa mãe que tinha a opção na bios de ligar ou desligar o suporte para elas continuarem energizando as portas usb mesmo após o desligamento do pc.
E já tive outra que tinha um jumper na placa mãe próximo aos conectores usb que habilitava a linha +5v das portas usbs para elas carregarem os dispositivos mesmo após o pc desligado também.
Veja se sua placa não se encaixa em alguma dessa duas opções.