Tentando decifrar o que o OP está querendo.
Eu pensei na possibilidade de que os programas "memorizaram" onde são abertos(tela no caso) e no caso no segundo monitor, ao ligar apenas um monitor e abrir os respectivos aplicativos eles simplesmente não abrem no primeiro monitor, tendo que o OP tenha que fazer um enorme sacrifício físico para ligar o segundo monitor.
Solução, é desativar temporariamente o segundo monitor, reinstalar os dois aplicativos em questão, ligar o segundo monitor e arrasta-lo de novo para o segundo e se lembrar de arrasta-los novamente para o primeiro monitor antes de desligar o pc, assim evitando o programa salvar a ultima localização da janela/programa no segundo monitor.
Será que é isso!?