Então, acrescentei mais uma memoria de 4gb, e resolveu, acho que era isso mesmo, ele tentava por o acesso no ssd e dava estas travadas....pode ser que o swapfile tá no SSD, e quando o sistema vai ler / gravar nesse arquivo ocorre o stuttering.
tenta mudar o arquivo de swap para o HD e posta os resultados.
obs: eu tinha 4gb antes, agora estou com 8gb...