Também só uso cartão virtual do Banco do Brasil (Ourocard-e usando Petrobras) no Mercado Pago e em compras online, sendo que eu deixo o cartão cadastrado no app mas bloqueado, só desbloqueando logo antes de realizar a recarga. Porém, no começo do mês o BB bloqueou o meu cartão para transações online (presencial ainda funcionava) por segurança, pois segundo o banco, houve seguidas tentativas de compras nele, que não foram bem-sucedidas pois ele fica bloqueado. O banco não me informou qual serviço tentou fazer transações, mas conhecendo a péssima reputação da segurança do Mercado Pago, tenho fortes suspeitas que foi lá.
Fiquei três semanas me virando com o cartão virtual do Nubank até receber a 2ª via essa semana. Depois dessa, eu não vou mais deixar cartão virtual salvo no Mercado Pago, prefiro ter o trabalho de toda vez criar um novo cartão virtual e já excluir logo após a recarga. O Mercado Pago tem sim esse problema de segurança.