Se é uma particular boa e vc gosta do curso eu continuaria ai, não adianta ir pra universidade pública se não é o curso que tu quer e se o nível entre as duas não for tão diferente.
Agora se vc estudar numa particular de pouca qualidade/renome eu aconselharia ir pra federal, pois mesmo depois é tranquilo conseguir transferência interna pra eng. civil lá(que é mto boa, digassi de passagi)
Eu nunca quis uma engenharia especifica, eu tenho na minha mente que eu quero fazer alguma engenharia não importa qual, eu tentei a civil por ser a mais popular e acabei gostando da ideia de construir um prédio.
Por enquanto eu creio que eu vou pra aeronáutica mesmo, se eu quebrar a cara não tem problema eu tenho 18 anos ainda tenho tempo e na federal vou possuir a opção de transferência interna como você disse.