esse problema é coisa de periféricos de interação mesmo. lembro que no passado, jogando não lembro o quê (acho que ut2k4) na minha antiga radeon9600pro capada, a imagem ficava freezing o tempo todo. o telefone tocou e eu deixei o jogo rodando (single player, partida com bots), e enquanto eu tava no telefone olhei pra a tela, e estava rodando perfeito, completamente fluente, os bots se mexendo e atirando em mim sem parar, um monte de efeitos na tela. então voltei pro pc, e notei que era quando eu mexia no mouse pro jogador olhar ao redor, que dava esses freezings. soltei o mouse e comecei a usar as setinhas do teclado pra fazer o meu boneco olhar, e ficou perfeito, sem freezings. Não lembro o que eu fiz na época pra corrigir. mas era problema outro que a placa.
Eu comprei também uma 8800gts 320 com over de fábrica, a segunda com maior over de fábrica, das que estão no mercado (
http://www.tomshardware.com/2007/05/17/performance_value_for_dx10/ ). Lí sem parar por quase dois meses apenas sobre a série 8800, e estava pesquisando sobre qual placa comprar já tinha mais de 4 meses (ia comprar uma 1950 xt, até lançarem as 8800gts 320mb), e se tivesse acontecido esses problemas com o chip 8800 eu com certeza teria lido a respeito. A ÚNICA coisa estranha que eu notei durante todo esse tempo de pesquisa, foi a EVGA e-GeForce 8800 GTS 320MB ACS3 and SuperClocked (
http://www.anandtech.com/video/showdoc.aspx?i=2953&p=3 ), que é a com clocks mais altos das 320mb (e que não é a sua, pelo que eu lí no fórum), ter sumido completamente do mercado em menos de uma semana, exatamente a semana em que eu tava fazendo a encomenda das minhas peças. Pensei que podia ter sido um recall da evga por causa de algum problema, mas como não achei nada na imprensa, simplesmente deixei pra lá e peguei a foxconn.
Bem, o ideal mesmo era vc fazer o teste com outra placa mãe e com outros periféricos de entrada. Mandar a placa pra a garantia, gastando uma grana com frete, pra ou receber ela de volta por estar funcionando ou receber uma nova que vai continuar te dando problema, não é uma opção.
Acho que já perguntaram, mas eu lí o tópico rapidamente. Vc instalou o driver usb da sua placa mãe? é usb 2.0? desinstalou os drivers de todos os outros controladores que vc possa ter (joysticks, manches) e/ou desconectou os mesmos do pc? já tentou usar teclados e mouses usb? caso vc já use teclado e mouses usb, já tentou com peças ps2? desativou componentes não essenciais do pc pra testar (placas wireless, placa de som offboard [principalmente se tiver aquelas entradas antigas pra joysticks que eu nem lembro o nome, parece uma porta paralela]).
É meio difícil mesmo isolar o problema, pq basicamente vc não tem como fazer muitos testes, uma vez que não tem peças sobressalentes ou vizinhos com configs semelhantes. Boa sorte.