Hmmm... Particularmente quando eu uso eu dou preferência à aplicativos Modern... Mas ainda estou na fase de descoberta. Por enquanto:
Internet Explorer
Files&Folders (gerenciador de arquivos)
Key Lock Notifier (para avisar do acionamento do Num Lock e do Caps Lock) Uso em conjunto com um outro programa de Área de Trabalho chamado TrayStatus. Não é uma combinação 100%, mas é a alternativa que restou...
SimpiRSS (um leitor de RSS)
Pinball Star (basicamente um clone do Pinball que a Microsoft tirou no Windows Vista)
Aplicações nativas (Calculadora, Leitor de PDF, Clima, Configurações do Computador...)
Pendente (pretendo testar em algum momento):
VLC
Microsoft Office 365 (que em breve deve sair uma versão para o Modern)
Tem duas aplicações Modern que eu acabo não usando porque elas exigem conta da Microsoft sem necessidade:
E-mail, Calendário e Pessoas (uso o Opera Mail no lugar)
Skype (utilizo o Skype para a Área de Trabalho)
Particularmente eu gosto da forma como as aplicações Modern funcionam, pelo seu processo de instalação ser bem mais fácil e simples, muito mais seguro (não requer privilégios administrativos, tem acesso limitado ao sistema, dificultando muito a distribuição de malwares junto com os programas) e funcionarem bem com tela sensível ao toque (infelizmente com um desktop tradicional ou um notebook sem touchscreen realmente é complicado, e a Microsoft precisa achar um jeito de resolver isso).
Edit: a propósito, alguém sabe onde é que eu posso fazer a alteração das notificações para que o Windows exiba uma notificação de bateria fraca? Eu estou com um notebook e em 2 meses e meio ele não deve ter avisado mais do que 2 vezes antes dele se desligar automaticamente, e isso é um tanto incômodo... Aparentemente ele se desliga quando chega nos 10%, então o Windows teria que avisar quando estivesse com 15% ou algo assim...
Edit2: consegui resolver:
http://windows.microsoft.com/pt-br/windows7/how-do-i-change-the-low-battery-notification