Quando você faz o root passando um kernel modificado, é instalado o Menu CWM (pra instalar ROM alternativa, fazer os "wipe"s, etc.) e nele tem a opção de fazer o backup de toda a ROM que está instalado, com os aplicativos e configurações.
Assim, caso você mude de ROM e não goste da nova, basta ir no Menu (ou se não estiver instalado no Android, ligar o aparelho em modo Recovery - "Aumenta Volume + botão Home + botão de ligar") e mandar restaurar o Android (em uns 10 minutos ele restaura tudo e liga o celular como se você tivesse mexido em nada).